Das Präsidium ist das Leitungsgremium sowie das oberste Exekutivorgan der ÖAW. Es besteht aus dem Präsidenten bzw. der Präsidentin, dem Vizepräsidenten bzw. der Vizepräsidentin und zwei Klassenpräsident:innen. Aktuell bilden Präsident Heinz Faßmann, Vizepräsidentin Ulrike Diebold, Klassenpräsidentin Christiane Wendehorst und Klassenpräsident Wolfgang Baumjohann das Präsidium.
Die Mitglieder des Präsidiums werden von der Gesamtsitzung aus der Reihe der wirklichen Mitglieder der Akademie gewählt. Dem Vier-Augen-Prinzip folgend sind Präsident und Vizepräsident für die Geschäftsführung und Agenden der Forschungsinstitute der ÖAW, die beiden Klassenpräsident:innen für die Aktivitäten der Mitglieder beider Klassen verantwortlich.
