Besonders intensive Kooperationen pflegt das WBÖ mit den folgenden Projekten bzw. Forschungsgruppen:
- SFB "Deutsch in Österreich. Variation - Kontakt - Perzeption"
- Austrian Dialect Cartography 1924-1956
- Bayerisches Wörterbuch (BWB)
- Dialektologisches Informationssystem für Bayerisch-Schwaben (DBIS)
- Forschungszentrum Deutscher Sprachatlas
- Fränkisches Wörterbuch (FWB)
- Sprachatlas von Oberösterreich (SAO)
- Verba Alpina
- Wörterbuch der Ungarndeutschen Mundarten (WUM)
- Zentrum für digitale Lexikographie der deutschen Sprache (ZDL)