Thomas Ellis

Current projects:

Genetic and environmental factors influencing methylation variation

DNA methylation varies enormously within natural lines of Arabidopsis thaliana, and is correlated with ancestry, climate, and transponson load, among other things. However, its practical relevance for natural populations remains unclear. In this project we use crosses and field experiments to experimentally disentangle these correlations and identify the genetic and environmental factors influencing methylation variation.

Publications:

Durán, P., Ellis, T. J., Thiergart, T. , Ågren, J. & Hacquard, S.,(2022) Climate drives rhizosphere microbiome variation and divergent selection between geographically distant Arabidopsis populations. New Phytologist, 236: 608–621. DOI: https://doi.org/10.1111/nph.18357
Ellis, T. J., Postma, F. M., Oakley, C. G., & Ågren, J. (2021). Life‐history trade‐offs and the genetic basis of fitness in Arabidopsis thaliana. Molecular Ecology, 30(12), 2846-2858. DOI: https://doi.org/10.1111/mec.15941
Thiergart, T., Durán, P., Ellis, T., Vannier, N., Garrido-Oter, R., Kemen, E., Roux F., Ågren J., Schulze-Lefert, P. & Hacquard, S. (2020). Root microbiota assembly and adaptive differentiation among European Arabidopsis populations. Nature Ecology & Evolution, 4(1), 122-131. DOI: https://doi.org/10.1038/s41559-019-1063-3
Ellis, T. J., Field, D. L., & Barton, N. H. (2018). Efficient inference of paternity and sibship inference given known maternity via hierarchical clustering. Molecular Ecology Resources, 18(5), 988-999. DOI: https://doi.org/10.1111/1755-0998.12782
Ellis, T. J., & Field, D. L. (2016). Repeated gains in yellow and anthocyanin pigmentation in flower colour transitions in the Antirrhineae. Annals of Botany, 117(7), 1133-1140. DOI: https://doi.org/10.1093/aob/mcw043
Streinzer, M., Ellis, T, Paulus, H. F., & Spaethe, J. (2010). Visual discrimination between two sexually deceptive Ophrys species by a bee pollinator. Arthropod-Plant Interactions, 4(3), 141-148. DOI: https://doi.org/10.1007/s11829-010-9093-4

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